PPPoE (билайн у которого нету L2tp)+PPtP - iDeco

Очень странное поведение!
LAN2-iDeco-MT - х(таблица маршрутизации) - LAN1 - не работает
Ничего не должно мешать.
Пробуйте все-таки другую версию...

 

У правила, которое на скрине есть такие настройки, из-за них может быть такое поведение?

 

нет из-за него не может быть, это стандартное правило...

 

6.39.3 (Bugfix only) версия старее чем у меня прошивка =) Будем ждать тогда...? Вопрос, если поменять прошивку, заново нужно будет заливать Backup настроек?

 

Можно current версию использовать 6.40.5. Если просто downgrade сделаете бэкап не должен потребоваться.